Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a1P19437 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms