Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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