Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Hoxb1P17919 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Hoxb1P17919 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Hoxb1P17919 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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