Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Irf1P15314 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Irf1P15314 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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