Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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