Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Ifnb1-201ENSMUST00000055671 750 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb4P10284 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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