Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col3a1P08121 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms