Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Prm2P07978 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Prm2P07978 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Prm2P07978 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Prm2P07978 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Prm2P07978 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Prm2P07978 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Prm2P07978 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Prm2P07978 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Prm2P07978 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Prm2P07978 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prm2P07978 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms