Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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