Protein–RNA interactions for Protein: P01755

Ig heavy chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01755 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01755 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01755 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01755 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
P01755 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01755 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01755 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01755 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01755 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01755 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01755 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01755 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
P01755 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01755 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01755 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01755 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01755 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01755 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01755 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01755 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01755 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01755 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01755 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01755 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
P01755 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms