Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01647 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01647 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01647 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01647 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01647 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01647 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01647 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01647 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms