Protein–RNA interactions for Protein: P01646

Ig kappa chain V-V region HP 123E6, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01646 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01646 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01646 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01646 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01646 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01646 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01646 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01646 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01646 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01646 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms