Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ifnb1P01575 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ifnb1P01575 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ifnb1P01575 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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