Protein–RNA interactions for Protein: O55055

Trdmt1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdmt1O55055 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdmt1O55055 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms