Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Clk2O35491 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms