Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Prrt1O35449 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Prrt1O35449 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Prrt1O35449 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Prrt1O35449 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Prrt1O35449 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Prrt1O35449 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Prrt1O35449 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Prrt1O35449 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Prrt1O35449 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Prrt1O35449 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Prrt1O35449 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Prrt1O35449 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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