Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casq1O09165 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casq1O09165 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casq1O09165 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casq1O09165 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casq1O09165 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casq1O09165 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms