Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms