Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3542K7N6U2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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