Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Gm21900J3QP38 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Gm21900J3QP38 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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