Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20834J3QM72 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
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