Protein–RNA interactions for Protein: H3BKF4

Gm20708, Predicted gene 20708, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20708H3BKF4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20708H3BKF4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms