Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HrcG5E8J6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms