Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms