Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms