Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms