Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M1F7CXU4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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H2-M1F7CXU4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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H2-M1F7CXU4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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H2-M1F7CXU4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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H2-M1F7CXU4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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H2-M1F7CXU4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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H2-M1F7CXU4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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H2-M1F7CXU4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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H2-M1F7CXU4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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H2-M1F7CXU4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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H2-M1F7CXU4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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H2-M1F7CXU4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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