Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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