Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5218F6YH22 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms