Protein–RNA interactions for Protein: F6XJP7

Pcsk6, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk6F6XJP7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk6F6XJP7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk6F6XJP7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk6F6XJP7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk6F6XJP7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk6F6XJP7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk6F6XJP7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk6F6XJP7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk6F6XJP7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk6F6XJP7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk6F6XJP7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk6F6XJP7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk6F6XJP7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk6F6XJP7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcsk6F6XJP7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms