Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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