Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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