Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms