Protein–RNA interactions for Protein: F2Z403

Defa27, Defensin, alpha, 27, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa27F2Z403 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa27F2Z403 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms