Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmod3E9QA62 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms