Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Reg2-201ENSMUST00000023906 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3250E9Q1M3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms