Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms