Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Phf11cB4XVP9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Phf11cB4XVP9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Phf11cB4XVP9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Phf11cB4XVP9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Phf11cB4XVP9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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