Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5483B2RV77 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5483B2RV77 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5483B2RV77 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5483B2RV77 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5483B2RV77 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5483B2RV77 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5483B2RV77 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5483B2RV77 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5483B2RV77 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5483B2RV77 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5483B2RV77 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5483B2RV77 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5483B2RV77 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5483B2RV77 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5483B2RV77 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5483B2RV77 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5483B2RV77 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5483B2RV77 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms