Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms