Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms