Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ssxb8B1AY40 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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