Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms