Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Prr16A3KMN5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Prr16A3KMN5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Prr16A3KMN5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Prr16A3KMN5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Prr16A3KMN5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Prr16A3KMN5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Prr16A3KMN5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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Prr16A3KMN5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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Prr16A3KMN5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms