Protein–RNA interactions for Protein: A2VDH3

Lrrc38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, mousemouse

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Length 298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc38A2VDH3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc38A2VDH3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc38A2VDH3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc38A2VDH3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc38A2VDH3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc38A2VDH3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc38A2VDH3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc38A2VDH3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc38A2VDH3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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