Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms