Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pramef6A2A8M8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pramef6A2A8M8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pramef6A2A8M8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pramef6A2A8M8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pramef6A2A8M8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms