Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm5538W4VSP6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm5538W4VSP6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm5538W4VSP6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5538W4VSP6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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