Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms