Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms